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精准基因组医学研究室
发布日期:2023-03-28          欧洲杯开户平台


一、团队简介

精准基因组医学(Genomic and Precision Medicine团队的研究方向是,以精准医学为导向利用基因组、转录组、表观组等多组学手段,结合高通量测序以及细胞和疾病动物模型,研究包括分子机制及诊断。主要包括两方面的研究:(1)神经系统疾病或肿瘤等疾病中的微生物-宿主互作及其表观调控;(2)遗传病的致病机制及其诊治。

实验室主页网址请见:https://www.x-mol.com/groups/chenlab

二、团队负责人简介

陈建欢,博士,欧洲杯开户平台教授,博士生导师,医学遗传学教研室主任,精准基因组医学实验室/欧洲杯开户平台-广东省科学院动物研究所“慢性病灵长类研究“联合实验室负责人,欧洲杯开户平台一流学科建设团队成员。中山大学生物技术/计算机科学与技术专业学士,香港科技大学生物化学(分子医学)博士,香港中文大学博士后。2012年起任汕头大学欧洲杯开户平台教授。2016年起任欧洲杯开户平台欧洲杯开户平台教授。主要从事研究微生物-宿主互作中的作用及表观调控机制等,研究成果在顶级学术期刊发表SCI论文40多篇,累计影响因子超过170。主持3项国家自然科学基金在内的国家级省级科研项目10项,与国内科研院所和企业合作完成科研服务项目6项,申请国家发明专利8项,已获授权1项。入选广东省特支计划百千万工程青年拔尖人才、扬帆计划培养高层次人才、江苏省高层次创新创业人才引进计划“双创博士”、江苏省“六大人才高峰”项目、无锡“太湖人才计划”创新领军人才。任Frontiers in Genetics副主编(影响因子4.6)、Frontiers in Psychiatry副主编(影响因子4.1)、Frontiers in Molecular Neuroscience客座编辑和30多个SCI期刊审稿人,江苏省免疫学会转化医学专业委员会委员,国家自然科学基金、教育部高校科学研究优秀成果奖、广东省杰出青年基金和浙江省杰出青年基金等多个国家级、省级项目和科技奖评审专家,广东省高层次人才评审专家库成员。

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研究方向

1.微生物-宿主互作及其表观调控。

2.遗传病的分子机制、诊断和基因治疗。

主持的主要科研项目

1.国家自然科学基金面上项目(2项)

2.国家自然科学基金青年项目

3.广东省科技计划社会发展类项目

4.广东省自然科学基金面上项目(2项)

5.中央高校基本科研重点项目(共同主持)

6.中央高校基本科研业务费专项资金

7.无锡卫生健康委员会转化医学项目

入选人才项目

1.广东省特支计划百千万工程青年拔尖人才

2.广东省扬帆计划培养高层次人才

3.江苏省高层次创新创业人才引进计划“双创博士”

4.江苏省“六大人才高峰”项目(罕见病的精准医学及靶向治疗研究平台)

5.无锡“太湖人才计划”创新领军人才

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近5年发表的第一或通讯作者论文:

1.Zhi-Yuan Wei#, Zhi-Xin Wang#, Jia-Huan Li, Yan-Shuo Wen, Di Gao, Shou-Yue Xia, Yu-Ning Li, Xu-Bing Pan, Yan-Shan Liu, Yun-Yun Jin*,Jian-Huan Chen*. Host A-to-I RNA editing signatures in intracellular bacterial and single-strand RNA viral infections.Frontiers in Immunology.In press.

2.Kong F, Ren C, Jia R, Zhou Y,Chen J*, Ma Y*. Systematic Pan-Cancer Analysis Identifies SLC31A1 as a Biomarker in Multiple Tumor Types.BMC Medical Genomics.2023 accepted.

3.Ying Chen, Fu-Xia Ru, Jun-Jie Feng, JJi Tao, Zhi-Yuan Wei, Chengjia Qian, Qiong Lin*,Jian-Huan Chen*. Gastric juice microbiota in pediatric chronic gastritis clinically tested positive and negative for Helicobacter pylori.Frontiers in Microbiology. 2023 accepted.

4.He A, Wang P, Zhu A, Liu Y,Chen J*, Liu L*. Predicting IDH Mutation Status in Low-Grade Gliomas Based on Optimal Radiomic Features Combined with Multi-Sequence Magnetic Resonance Imaging. Diagnostics.Diagnostics; 2022;12(12):2995.

5.Wei ZY#, Rao JH#, Tang MT, Zhao GA, Li QC, Wu LM, Liu SQ, Li BH, Xiao BQ, Liu XY,Chen JH*.Characterization of changes and driver microbes in gut microbiota during healthy aging using a captive monkey model.Genomics Proteomics and Bioinformatics,2022.

6.Zhang X, Li M, Li B, Liao N, Wei Z, Gao J, Sun Y,Chen J*, Rao J*, Wen F*. Ageing fundus degenerations of Macaca fascicularis on multi-modal imaging and histopathology: Similarities and differences compared to human.Experimental Eye Research.2022;220:109126.

7.Zhang JQ#, Pan JQ#, Wei ZY, Ren CY, Ru FX, Xia SY, He YS,Lin K*, Chen JH*. Brain Epitranscriptomic Analysis Revealed Altered A-to-I RNA Editing in Septic Patients.Frontiers in Genetics.2022;13.

8.Ru FX#, Kong F#, Ren CY, He YS, Xia SY, Li YN, Liang YP, Feng JJ, Wei ZY,Chen JH*. Repeated Winning and Losing Experiences in Chronic Social Conflicts Are Linked to RNA Editing Pattern Difference.Frontiers in Psychiatry. 2022;13.

9.Gao JM#, Rao JH#*, Wei ZY#, Xia SY, Huang L, Tang MT, Hide G, Zheng TT, Li JH, Zhao GA, Sun YX,Chen JH*. Transplantation of Gut Microbiota from High-Fat-Diet-Tolerant Cynomolgus Monkeys Alleviates Hyperlipidemia and Hepatic Steatosis in Rats.Frontiers in Microbiology. 2022;13.

10.Zhang J, Tao J, Gao RN, Wei ZY, He YS, Ren CY, Li QC, Liu YS, Wang KW, Yang G, Qian C*,Chen JH*. Cytotoxic T-Cell Trafficking Chemokine Profiles Correlate With Defined Mucosal Microbial Communities in Colorectal Cancer.Frontiers in Immunology. 2021;12:3274.

11.Xia Y#*, Wei ZY#, He R, Li JH, Wang ZX, Huo JD,Chen JH*. Hybrid de novo Genome Assembly of Erwinia sp. E602 and Bioinformatic Analysis Characterized a New Plasmid-Borne lac Operon Under Positive Selection.Frontiers in Microbiology.2021;12:3471.

12.Liu YS, Pan JQ, Wan JF, Ren CY, Xu ZH, Pan XB, Gao RN, Liu SQ, Zhang JL, Yao QH, Wang JH, Li EM, Rao JH, Hou P*,Chen JH*. A novel missense mutation of RPGR identified from retinitis pigmentosa affects splicing of the ORF15 region and causes loss of transcript heterogeneity.Biochemical and Biophysical Research Communications. 2020;531(2):172–9.

13.Tao J, Ren CY, Wei ZY, Zhang F, Xu J*,Chen JH*. Transcriptome-Wide Identification of G-to-A RNA Editing in Chronic Social Defeat Stress Mouse Models.Frontiers in Genetics. 2021;12:701.

14.Liu Z, Wei Z-Y, Chen J, Chen K, Mao X, Liu Q, Sun Y, Zhang Z, Zhang Y, Dan Z, Tang J, Qin L,Chen JH*, Liu X*. Acute Sleep-Wake Cycle Shift Results in Community Alteration of Human Gut Microbiome.mSphere. 2020.5(1).

15.Xue CB#, Xu ZH#, Zhu J, Wu Y, Zhuang XH, Chen QL, Wu CR, Hu JT, Zhou HS, Xie WH, Yi X, Yu SS, Peng ZY, Yang HM, Hong XH*,Chen JH*.Exome Sequencing Identifies TENM4 as a Novel Candidate Gene for Schizophrenia in the SCZD2 Locus at 11q14-21.Frontiers in Genetics.2018;9.

16.Luo X#, Chen S#, Xue L,Chen JH*,Shi YW*, Zhao H*. SNP Variation of RELN Gene and Schizophrenia in a Chinese Population: A Hospital-Based Case–Control Study.Front. Genet.2019;10.

17.Wang KW#, Xiao BQ#, Li BH, Liu YY, Wei ZY, Rao JH*,Chen JH*. Effects of fat-to-sugar ratio in excess dietary energy on lipid abnormalities: a 7-month prospective feeding study in adult cynomolgus monkeys.Lipids Health Dis.2019;18(1):1.

18.Yu M, Wei ZY, Xu ZH, Pan JQ,Chen JH#. Oxidative Damage and Nrf2 Translocation Induced by Toxicities of Deoxynivalenol on the Placental and Embryo on Gestation Day 12.5 d and 18.5 d.Toxins.2018; 10(9):370.

19.Wu HK#,Chen JH#, Yang L, Li AR, Su D-H, Lin YP, Chen DQ. Emergence and genomic analysis of MDR Laribacter hongkongensis strain HLGZ1 from Guangzhou, China.J Antimicrob Chemother.2018;73(3):643–7.

三、团队成员简介


马亚萍,儿科学博士,副主医师,硕士研究生导师,欧洲杯开户平台欧洲杯开户平台儿内科副主任。现任江苏省医学会儿科分会小儿内分泌学组委员,江苏省妇幼健康研究会第一届儿童生长发育促进专业委员会委员,为无锡市“双百”中青年医疗卫生后备拔尖人才、无锡市医学重点人才培育对象。在小儿内分泌领域的临床和研究已有17余年,曾在美国霍普金斯欧洲杯开户平台和儿童医院进修小儿内分泌临床和研究一年。近年来先后获得省级新技术新项目引进奖和市科技进步奖等,在《Frontiers in Physiology》、《Endocrinology》、《BMC Pediatr》、《BMC Medical Genomics》等权威性学术期刊上发表学术论文30余篇,其论文参加过国际(亚洲儿科大会和亚太儿科大会壁报交流)及全国、江苏省儿科内分泌年会(大会发言)交流。擅长小儿常见内分泌疾病如性早熟、特发性矮小等的诊断和治疗。

主要从事儿童下丘脑-垂体-性腺轴等相关的儿童内分泌、遗传代谢性疾病的研究。


刘彦山,博士,副研究员。近五年获得包括国家自然科学基金面上基金在内的4项省级以上课题资助。发表SCI论文15篇,其中以第一作者或通讯作者发表4篇,共同作者1篇。研究发现为单基因遗传病致病机制及基因治疗。

担任SCI期刊Frontiers in genetics、Frontiers in Psychiatry审稿编辑,Clinical Oral Investigations,BMC Medical Genomic等杂志审稿人。


金云云,博士,讲师。在Front Microbiol、Virol Sin、J Cell Physiology以及Cell Biosci等国际期刊上发表SCI论文共13篇,累计影响因子为94,其中以第一作者和通讯作者身份发表SCI论文7篇,中科院2区的共4篇。申请并获批国家发明专利2项。参与国家自然科学基金面上项目以及省级项目共6项。

主要研究方向:病毒自身复制与转录机制;病毒对宿主RNA编辑影响及作用机制。


潘旭斌,博士,副主任医师,硕士研究生导师,江苏省医师协会青光眼与防盲学组委员。擅长:儿童及青少年近视防控、视网膜疾病以及遗传性眼病的诊断与治疗。

研究方向主要为近视防控与视网膜疾病方向。主要研究兴趣是视网膜遗传病的致病机制及其诊治,儿童及青少年近视发病机制。

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